フリーのUniversal Application
Chicken of the VNC　（VNC クライアント）
CleanArchiver　（圧縮ソフト）
DivX Player　（DivXプラグイン・プレーヤー）
RealPlayer　（リアルプレーヤー）
Skype　（無料通話・チャット）
StuffIt Expander 10.1 beta　（解凍ソフト）

有料のUniversal Application
FileMaker Pro 8　（DBソフト）
Jedit X　（エディター）
Transmit3　（FTPソフト）
VirusBarrier X4　（セキュリティ）
egbridge Universal　（入力）

BootCampのWinで導入したapplication
AppleK Pro　（WinでMacのキーボード配列が使える）
MacDrive 6　（BootCamp使用時にWinからMacのHDDをマウント出来る）

とりあえず、こんなところでしょうか。